أصدر قائد الثورة الإسلامية، الإمام الخامنئي، بياناً أعرب فيه عن تعازيه بوفاة آية الله السيد محمد البجنوردي، وجاء نص بيان التعزية كما يلي:   
   
بسم الله الرحمن الرحيم،   
أقدّم التعازي بوفاة آية الله السيد محمد البجنوردي إلى ذويه الكرام، سائلاً الرحمة والمغفرة الإلهية له.   

السيد علي الخامنئي   
25/2/2024